隐藏动物作为疯狂动物园的核心收集要素，其获取依赖于完成特定挑战或满足特殊条件，而非随机遭遇。这些动物分布于不同主题地图，解锁方式具有明确的指向性，玩家需针对性地规划操作。草原地图的隐藏动物解锁条件较为基础但考验操作持续性。骑乘同一只野牛不间断前进800米可解锁暗黑野牛，而特洛伊斑马则要求玩家在一局游戏中连续换乘七种不同的草原动物。狮子类隐藏动物如油炸狮，需使用同一只狮子连续吞噬三十只其他动物；哭吼狮可通过连续换乘五只狮子或单只狮子吞噬三十只动物达成。机械秃鹰出现于1400米后的巨石上，通常需借助长颈鹿或大象狂暴后被甩至高处的时机捕捉。
丛林与山脉地图的解锁条件更强调换乘技巧与长距离骑乘。在丛林区域，骑乘同一只河马行进1600米（多见于2000米后水域密集区）可召唤鸭嘴河马；恐龙犀牛需连续换乘七种丛林动物；三嘴鸟则要求骑乘巨嘴鸟并在其暴走至最高点时起跳，完成100米飞行后安全换乘。山脉地图中，苏-24战斗熊需骑乘同一只老鹰飞行2000米；蒸汽朋克兽要求骑牦牛撞飞十只动物（复活不影响计数）；纯黑鹿需在非山脉地图开局并连续换乘八种动物；罗宾汉鹰需沿跑道边缘灌木丛方向冲刺跳跃至最远山峰。
澳洲及极地等地图的隐藏动物解锁结合环境互动与数量要求。炸弹袋熊需袋熊单次撞击击飞四只动物；变色骆驼要求连续换乘八种澳洲或外来动物；侦查蝠需破坏地图中的风车建筑；沼泽考拉怪在2000米后燃烧的火树上刷新。极地区域的剑齿海象需在2000米后从超大巨石跳下，雪兔则要连续骑乘六只北极兔。部分动物如雄鸡鳄仅在凌晨3点至10点限时出现，而幽灵企鹅需游戏内处于冬季。
除地图挑战外，系统机制也是获取途径之一。每日登录奖励与特定任务可能直接赠送隐藏动物碎片或解锁权限。升级动物栖息地等级是关键基础，例如极地区域升至7级解锁隐形企鹅，热带雨林区域9级解锁丛林蜥蜴。Boss任务作为随机事件，完成后可能获得骷髅象、火山猩猩等稀有品种。内购虽可快速解锁部分动物如独角兽（需魔法森林饲料），但通常建议作为备选方案。隐藏动物的获取是条件触发与策略执行的结合。玩家需熟悉各动物习性对应的解锁逻辑，优先提升栖息地等级以扩大触发范围，并针对性练习长距离骑乘、精准换乘及环境互动技巧。
