游戏开始时，玩家身处真新镇的家中，无需理会初始对话，直接向左上方移动找到电脑并取出一瓶伤药，之后下楼与妈妈对话得知需要寻找大木博士。走出家门后，玩家应向右下角的灰色建筑移动，遇到博士的孙子并得知博士不在，随后向上方草丛前进，在入口处被大木博士叫住并带回研究所。
在大木博士的研究所，玩家会遇见主要对手小茂，并从关东地区的御三家妙蛙种子、杰尼龟和小火龙中选择一只初始宝可梦，选择前建议存档以查看性格。选定宝可梦后，小茂会立即发起对战，他特意挑选属性克制的宝可梦，战胜他后玩家便可沿着1号道路继续前进，途中会遇到售货员赠送伤药。
击败劲敌后，玩家穿过1号道路抵达常磐市，进入道具商店从店员处领取大木博士的包裹，随后返回真新镇将包裹交给博士，换取宝可梦图鉴和五个精灵球。离开研究所后，玩家应前往自家左边的房子找到小茂的姐姐，她会赠送城镇地图，之后返回常磐市，发现原先挡路的老爷爷已起身，与他对话可获得教学电视机。
从常磐市向北进入2号道路，一位老爷爷会指导玩家捕捉宝可梦的方法，教学结束后赠送广播装置。玩家随后进入常磐森林，森林内主要分布着虫属性宝可梦，并有较低几率出现皮卡丘，建议提前准备解毒药。沿着森林右侧路径直走可避开复杂路线，途中会遇到若干训练家对战，击败他们能积累经验值，走出森林后继续向北行进即可到达尼比市。抵达尼比市后，玩家首要目标是挑战岩石系道馆，馆主小刚使用小拳石和大岩蛇，火系或水系技能能有效克制。道馆内需解开简单的岩石机关，观察地面图案可找到正确路线，获胜后获得灰色徽章。
