火影忍者忍术大师通关的核心在于掌握二代目火影千手扉间的飞雷神之术特性与关卡机制结合。第一关需利用飞雷神二段突进范围，开局后在Y轴释放技能后迅速切换至另一Y轴再次释放，可一次性清除上下两排稻草人。第二关稻草人布局分散，需按特定顺序操作：先位移至上方Y轴向右释放飞雷神，再移动至下方Y轴向左释放，最后平A处理边缘目标并回归原位完成清理。关键点在于通过飞雷神标记实现瞬移与分身爆炸的联动效果。
第三关考验飞雷神标记与影分身置换的时机把控。轻按二技能将福禄丸击飞后立即释放一技能飞雷神，利用分身爆炸伤害突破起爆符区域。第四关延续相同原理，需精准触发飞雷神术式印记实现瞬移脱离结界。若采用平A触发术式需确保最后一下命中福禄丸，否则可能因位置偏差导致失败。第五关需结合波乘击的水龙卷效果，将左侧目标卷至中心后衔接奥义技能实现全屏清场。
活动关卡设计均围绕飞雷神之术的三种特性展开：二段突进范围、标记瞬移机制以及分身爆炸伤害。通关时长直接影响写轮眼评价等级，从瞳术见习至瞳术大师共分六档。若时间不足可提前退出关卡重置进度，但需注意必须在倒计时结束前操作，否则将强制进入下一阶段。跨天未领取的奖励会通过邮件补发，成就系统则提供额外资源奖励。
针对高难度关卡，建议采用分阶段记忆差异点的策略。通过截图暂停或多次尝试熟悉固定图案布局，利用时间重置机制反复练习。第三关的三张动态图需尤其注意细节变化，优先标记显眼区域再逐步排查细微处。系统会根据总通关时长授予最终称号，因此需平衡速度与准确率，避免因追求单关速通导致后续容错率下降。
忍者学员可通过游戏内瞳术大师活动界面查看实时排名与历史最佳记录。该模式要求同时具备观察力与操作精度，建议将设备亮度调至最高以提升暗部细节辨识度。部分机型支持分屏功能，可同步对照参考图提升效率。所有关卡图案组合均为固定算法生成，掌握规律后可显著降低重复挑战的难度。
